Mi lenne, ha az országok emberek lennének? Nagyon egyszerű, rövid történetekben mutatja be az anime az egyes hatalmak játszmáit az 1. és a 2. világháborúban. Leginkább a tengelyhatalmak, Japán, Németország és (Észak-)Olaszország kerülnek előtérbe, de láthatjuk Magyarországot is.

Gon Freeks átlagos napjait éli Whale Islanden (Bálna-sziget), mikor egy nap megjelenik Kaito, egy Hunter (különleges jogokkal bíró vadász, aminek rengeteg típusa van, mint például fejvadász, kutató, szakács, és kártyájuk segítségével rengeteg kiváltságban részesülnek), aki régi mesterét, Jint keresi, akiről évek óta nem tudnak semmit, viszont a leghíresebb Hunterek között tartják számon. Kiderül, hogy Jin Gon apja, és Kaito felajánlja neki, hogy váljon Hunterré, mikor 12 éves lesz. Gon 2 év elteltével elindul Hunterré válni nevelőanyja nagy bánatára. Ez persze nem olyan könnyű, mint gondolná, mivel le kell tennie egy több fordulós vizsgát, ahol több száz, esetleg ezer ember közül csak néhányan maradhatnak. Ebben segítségére lesz Leorio, Kurapica és Killua.

Hasekura Kohei folyton csak költözött, változtatta a lakhelyét, iskoláit. Sokat látott, sokat tapasztalt, mégse voltak igazi értelembe vett barátai. Úgy dönt ezért, hogy vándormadár életének véget vet: megtelepedik az egyik szigeten, ahol még gyerekként élt egy ideig: Tamatsun, Japántól kissé távol eső szigeten. Tanulmányait egy 6 éves, viktoriánus stílusú angol iskolában, a Shuchikan Akadémián folytatja. Szeretne nyugalmas életet élni, ám azok a régi és új arcok, akikkel megismerkedik vagy újratalálkozik garantálják, hogy mindig legyen valami programja. Ebben nagy szerepe van legalábbis gyerekkori barátainak Kanade és Haruna Yukinak, a diáktanács vezetőinek, Sendo Erikának és Iorinak...

Kazuki Yotsuga egy átlagos diák attól eltekintve, hogy időről-időre robotokat lát, akik egymással harcolnak. Élményeit közzéteszi a weblapján, ezért mindenki elég furcsának nézi. Mígnem egy "őrült" tudós átküldi a párhuzamos világba, ahol ezek a robotok léteznek. Egyből egy harc közepébe csöppen, majd meg kell akadályoznia, hogy a RaRa sereg elfoglalja a világot.

Az anime története 60 évvel az eredeti játék története után játszódik, melyben Gilgamesh, aki a játék főhőse volt, legyőzte Druagát és lerombolta a tornyát, ezáltal békét hozott a világra. Király lett és várost emeltetett a Torony romjai köré, hogy biztosítsa, hogy az abban élő szörnyek ne szabadulhassanak rá újra a világra. 60 év telik el viszonylagos békében, mikor is elérkezünk az anime történetének kezdetéhez. Druaga Tornyát mostanra újjáépítették, maga Druaga is feltámadt valamilyen különös módon, Gilgamesh, egykori legyőzője viszont mostanra megfáradt öregember, aki képtelen újból felvenni a harcot a gonosz démonnal/istennel.